一百一十年前，中國內(nèi)憂外患，封建統(tǒng)治搖搖欲墜，西方列強鷹犬環(huán)伺，為救亡圖存，一批進步開明的知識分子認為“富強唯教育”，主張學習西方，改革教育。經(jīng)過洋務運動和甲午戰(zhàn)爭的失敗，使封建統(tǒng)治者認識到中國教育的空疏無用，下詔宣布“變法”，實行新政，改科舉，廢八股，興辦學堂。正是在這樣的歷史背景下，山東高等農(nóng)業(yè)學堂如一顆有著無限生命力的種子，穿破封建統(tǒng)治的凍土應運而生。
　　清光緒三十二年（1906年）一月，山東商務議員、農(nóng)工商務局總辦朱鐘琪奉山東巡撫楊士驤之命，籌辦濟南農(nóng)林學堂，是年八月定名為山東高等農(nóng)業(yè)學堂。九月，前翰林院編修、直隸補用道、時任直隸學務處參議兼直隸高等學堂監(jiān)督的王景禧調(diào)任山東高等農(nóng)業(yè)學堂監(jiān)督，該堂的其他12名職員、8名教員亦于九月前后到堂。九、十月間，山東高等農(nóng)業(yè)學堂開始招生，先設中等農(nóng)、林、蠶三科兼令補習普通學，三年畢業(yè)，升入本科，亦三年畢業(yè)。
　　宣統(tǒng)三年（1911年）王景禧卸任，由前翰林院編修、山東茌平人馬蔭榮接任山東高等農(nóng)業(yè)學堂監(jiān)督。民國二年（1912年）山東高等農(nóng)業(yè)學堂的監(jiān)督為張巖南。
　　1913年6月，山東巡按使根據(jù)國民政府教育部的規(guī)定，將山東高等農(nóng)業(yè)學堂易名為山東公立農(nóng)業(yè)專門學校，校長仍為張巖南。1914年，山東高等學堂（山東大學的前身）奉令停辦，部分師生分別轉(zhuǎn)入清末民初陸續(xù)成立的山東公立農(nóng)業(yè)、工業(yè)、商業(yè)等六所專門學校。
　　自1913年至1926年，山東公立農(nóng)業(yè)專門學校畢業(yè)農(nóng)學本科9個班、林學本科11個班，蠶學本科6個班，制絲本科1個班，農(nóng)學預科3個班，林學預科1個班，甲等蠶業(yè)1個班以及農(nóng)、林、蠶三科講習科14個班，共計學生1774人。歷任校長為張巖南（1913－1915）、周秉琨（1915－1917）、鞏秉秋（1917年春）、郭寶琳（1917年秋－1926年）。
　　1926年，奉系軍閥張宗昌督魯，下令在省城濟南重建山東大學。是年7月24日，山東省教育廳指示將山東公立農(nóng)業(yè)、工業(yè)、商業(yè)、礦業(yè)、法政、醫(yī)學六所專門學校合并，改建為省立山東大學，校長為當時的教育廳長、清末狀元王壽彭。
　　省立山東大學成立后，設農(nóng)、工、醫(yī)、法、文五個學院，共十三個系，農(nóng)學院下設農(nóng)學、林學、蠶學三系，仍在濟南東關外七里堡原山東公立農(nóng)業(yè)專門學校校址辦學，院長為日本早稻田大學畢業(yè)的原山東公立農(nóng)業(yè)專門學校校長郭寶琳。
　　1929年，南京國民政府教育部采納蔡元培先生的建議，指令將國立山東大學籌委會改為國立青島大學籌委會，決定收用私立青島大學的校產(chǎn)、校舍，將省立山東大學遷往青島，并更名為國立青島大學。
　　1930年4月，國立青島大學正式成立（1932年又改為國立山東大學）。農(nóng)學院設研究、推廣兩部及農(nóng)事試驗場，暫不招收本科生，院址仍設于濟南原山東公立農(nóng)業(yè)專門學校校址，院長為曾省。
　　1937年7月，中日戰(zhàn)爭全面爆發(fā)，國立山東大學奉命由青島遷往安徽安慶，再遷四川萬縣，1938年2月奉令停辦。設于濟南的研究、推廣兩部及農(nóng)事試驗場淪于敵手，成為日偽華北農(nóng)事試驗總場濟南支場。1939年9月，山東日偽政權(quán)利用該場西院，成立了山東濟南農(nóng)業(yè)職業(yè)學校，1941年更名為山東省立高級農(nóng)業(yè)職業(yè)學校，并延續(xù)至1948年與山東省立農(nóng)學院合并。在該校存在的9年中，校長幾經(jīng)更迭。首任校長為涂鳴，繼任校長為姜學海、秦振寰、高中行、張文達、王子彝。1945年國民黨接收后，又先后任白孟龍、孫景洛為校長。
　　1945年日寇投降，1946年國立山東大學在青島復校，仍設農(nóng)、工、文、理、醫(yī)五個學院，農(nóng)學院院長為李善勤。農(nóng)學院下設農(nóng)藝系 （系主任陳瑞泰）、園藝系（系主任盛誠桂）、水產(chǎn)系（系主任朱樹屏）、農(nóng)場（場長孫中信）。另設農(nóng)場于青島城陽。
　　1947年9月，國民黨山東省政府在濟南成立山東省立農(nóng)學院，任閆若珉為院長。該院設農(nóng)藝、園藝、林學三個系，有教職員60人。9月20日開始招生，錄取學生120人。
　　1948年9月24日濟南解放，中國人民解放軍軍事管制委員會派工作隊進駐山東省立農(nóng)學院，對該院實行接管。同年10月15日、11月14日、1949年11月，省立高級農(nóng)業(yè)職業(yè)學校、青州農(nóng)業(yè)?？茖W校、黃河水利?？茖W校先后并入省立農(nóng)學院。至1952年全國院系調(diào)整前，山東省立農(nóng)學院設有五個系、六個專修科，即農(nóng)藝系、園藝系、森林系、農(nóng)化系、水利系和水文專修科、測繪專修科、氣象?？菩蘅?、會計學專修科、林業(yè)專修科、畜牧獸醫(yī)專修科。有專任教師105人，其中教授17人，副教授22人，講師32人，助教34人。學院負責人為劉春安，不久劉春安奉命南下，遂由山東省實業(yè)廳副廳長耿光波兼任院長。院黨總支書記華山（兼副院長）。1950年10月，根據(jù)教育部通知要求，山東省立農(nóng)學院更名為山東農(nóng)學院。
　　1952年全國院系調(diào)整，山東大學農(nóng)學院、齊魯大學農(nóng)業(yè)專修科、南京大學園藝系果樹組和金陵大學園藝系先后并入山東農(nóng)學院，組建新的山東省農(nóng)學院，設有農(nóng)學系、園藝系、林學系等七個系和林業(yè)、畜牧獸醫(yī)、農(nóng)田水利等五個專修科。全院有教師145人，干部職員112人，工人152人，學生1175人。院黨委書記華山、院長陳瑞泰。由于師生的大量增加，原來的校舍不敷應用，學院由桑園遷至濟南洪家樓。
　　1958年9月29日，根據(jù)省委通知要求，山東農(nóng)學院由濟南洪家樓遷來泰安現(xiàn)校址，并與設在泰安的山東林學院、山東畜牧獸醫(yī)學院、泰安農(nóng)業(yè)學校、山東省濟南水利學校（亦剛由濟南遷來泰安）四所學校合并，成立山東農(nóng)業(yè)大學。1959年5月仍恢復山東農(nóng)學院及農(nóng)、林、牧、水四所中專學校。從1959年至1966年“文革”前，在校生一直穩(wěn)定在1600余名。
　　1966年，“文化大革命”爆發(fā)，9月，學院及各系先后成立了“文革”領導小組。在紅衛(wèi)兵組織的沖擊下，學院黨政組織陷于癱瘓，各項工作陷于停頓，學校停止招生5年之久。至1971年，始有第一批418名工農(nóng)兵學員入校，1977年恢復高考后，學院在校生達到1474人。
　　黨的十一屆三中全會以后，學校全面恢復和建立了正常的教學秩序，主動開展綜合改革，以智力和科技優(yōu)勢進入經(jīng)濟建設的主戰(zhàn)場，在教學、科研等方面取得了較好的成果。
　　1983年9月，經(jīng)省委、省政府批準，山東農(nóng)學院更名為山東農(nóng)業(yè)大學，校黨委書記先后為王成旺、陳挺、劉龍駒，校長先后為陳瑞泰、施培。學校設農(nóng)學系、植保系、園藝系等8個系、2個教學部，有教職員工1959人，學生2206人。
　　1995年以后，學校不斷更新教育思想觀念，深化改革，促進了學校的發(fā)展。這個時期，學校黨政負責人為李毓椿、鄒琦。1997年后，學校黨委書記為蓋國強，校長先后為馮承明、溫孚江。
　　1999年底，根據(jù)省委、省政府指示，山東農(nóng)業(yè)大學與山東水利專科學校合并，山東省林業(yè)學校并入，組成新的山東農(nóng)業(yè)大學，直至今天。學校黨委書記先后為蓋國強、苗仲華、邢善萍、徐劍波，校長為溫孚江。學校黨委、行政抓住國家深化改革和高等教育加快發(fā)展的大好時機，搶抓機遇、改革創(chuàng)新，大力推進內(nèi)部管理體制機制改革，堅持走內(nèi)涵發(fā)展道路，全面提高教育質(zhì)量，不斷實現(xiàn)學校事業(yè)的新跨越。期間，2003年建成南校區(qū)并投入使用；2006年，舉行了百年校慶；2012年，學校成為農(nóng)業(yè)部、國家林業(yè)局和山東省人民政府共建高校，學校首批獲批山東省應用基礎型特色名校建設；2015年，《山東農(nóng)業(yè)大學章程》，核準通過成為學校依法自主辦學、實施管理和履行公共職能的基本準則；2016年，“雙代會”審議通過《山東農(nóng)業(yè)大學 “十三五”發(fā)展規(guī)劃》，為學校未來發(fā)展描繪了新的藍圖。
　　經(jīng)歷百余年的風雨冰霜，當年的幼芽如今已經(jīng)成長為根深葉茂的參天大樹，她是中華民族百年來變法、求強的歷史產(chǎn)物，是幾代農(nóng)大人艱辛培植、精心呵護的結(jié)果?！叭耸掠写x，往來知古今”，通過回顧我校百余年來的歷史，將會更加激發(fā)我們對學校的熱愛，更加激發(fā)我們?yōu)橹腥A民族的偉大復興、為加快學校發(fā)展而更加積極工作的熱情，奮力爭取無愧于先輩、無愧于時代的新業(yè)績、新成就！