1966年5月16日，黨中央“五一六通知”發(fā)表后，院黨委成立了“文化大革命”辦公室，各系、科、室相應(yīng)成立了“文化大革命”工作組。

1966年8月15日，近百名學(xué)生退出院黨委召開的大會，到吉林大學(xué)去聲援那里造反派的“革命行動”。20日，校內(nèi)成立了第一個造反派群眾組織———紅衛(wèi)兵縱隊，不久改名為“八一五”革命造反大軍。持相反觀點的保守派學(xué)生則成立了紅衛(wèi)兵大隊，教職工中也成立了“七一”戰(zhàn)斗隊、“八二九”戰(zhàn)斗隊等群眾組織，“革”與“?！钡亩窢幱萦?。在“破四舊”“立四新”和“橫掃一切牛鬼蛇神”的口號下，造反派通過戴高帽游斗、抄家等多種粗暴的斗爭形式揪斗領(lǐng)導(dǎo)干部和老教師，對他們進行精神摧殘和肉體折磨。造反派還抬著檔案室的鐵柜去省委，用鎬頭當(dāng)場刨開，聲稱要取出院黨委整他們的“黑材料”。

同年9月，在造反派的反復(fù)折騰下，整個學(xué)院的工作陷入癱瘓狀態(tài)，一切教學(xué)、科研活動和黨的組織生活被迫停止。造反派學(xué)生還逼著已經(jīng)沒有實權(quán)的一些黨委成員開會，作出開除保守派學(xué)生黨員黨籍的決定。11月，保守派群眾組織紅衛(wèi)兵大隊和“七一”戰(zhàn)斗隊等基本上被壓垮，大部分人被迫離校。

1967年的8、9、10三個月，長春市的武斗上升到兩軍對壘、動用槍炮階段，大型武斗連續(xù)發(fā)生，人身安全沒有保障。在這種情況下，絕大多數(shù)師生被迫離?；丶?。學(xué)院在這一年多的時間里，出現(xiàn)了所謂“一不斗、二不批、三不改”的局面。學(xué)生不能上課，教職工不能上班，全院處于無政府狀態(tài)。這期間，大量儀器設(shè)備、圖書、食堂、武器庫、醫(yī)藥品庫等被砸被搶，大量珍貴資料流失，校園內(nèi)一片蕭條殘敗景象，公共財產(chǎn)損失嚴(yán)重。

1968年9月3日，吉林省革命委員會組成一支以吉林柴油機廠工人為主體、吉林軍區(qū)二師解放軍指戰(zhàn)員參加的百余人的工軍宣傳隊進駐學(xué)院，接管學(xué)院的黨、政、財、文大權(quán)。然而，工軍宣傳隊進駐學(xué)院，不是為了結(jié)束“文化大革命”，而是要完成“打破資產(chǎn)階級知識分子獨霸的一統(tǒng)天下”“徹底摧毀資產(chǎn)階級的教育制度，勝利完成學(xué)校的斗、批、改任務(wù)”。他們在“千萬不要忘記階級斗爭”的口號下，在學(xué)院搞深揭深挖階級敵人的所謂“清理階級隊伍”運動，制造了一起又一起的冤案，許多干部、教師無辜地蒙受不白之冤。“清理階級隊伍”運動進行了整整10個月。運動期間，整個學(xué)院籠罩著白色恐怖的氣氛，給干部、教師的精神和肉體造成了極大的傷害。

在“文化大革命”席卷全國的社會大背景下，年輕的長春光學(xué)精密機械學(xué)院無論如何也無法獨善其身。從1968年長春光學(xué)精密機械學(xué)院革命委員會成立，到1977年工軍宣傳隊撤離學(xué)院的9年時間里，學(xué)院教學(xué)科研設(shè)備遭到重大破壞，干部教師飽受冤屈，學(xué)院遭遇了發(fā)展史上最大的浩劫。然而，我們欣喜地看到，在這場災(zāi)難里，學(xué)院仍然有許多干部、教師和學(xué)生從各個角度對“文化大革命”進行了不同程度的抵制。他們在極端艱難的環(huán)境里，繼續(xù)潛心從事教學(xué)、科研，竭盡所能地推動學(xué)院發(fā)展。我們不會忘記，光機人曾在這場歷史災(zāi)難中展現(xiàn)的正直善良、堅毅自強。讓歷史來作證，這些品質(zhì)將同他們苦心孤詣保護的校園一起，永遠(yuǎn)昂立在祖國的春城。