本報(bào)訊（通訊員葉雯）6月27日，Cell（《細(xì)胞》）以長(zhǎng)文（Article）形式在線發(fā)表了我校醫(yī)學(xué)研究院、免疫與代謝前沿科學(xué)中心肖銳研究員與美國加州大學(xué)圣地亞哥分校（UCSD）付向東教授課題組的最新研究成果。
       論文題為“Pervasive Chromatin-RNA Binding Protein Interactions Enable RNA-based Regulation of Transcription”《RNA結(jié)合蛋白廣泛地與染色質(zhì)相互作用以實(shí)現(xiàn)RNA介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控》。肖銳是該文的共同第一作者和通訊作者。
       RNA結(jié)合蛋白在轉(zhuǎn)錄后的剪接加工、修飾、轉(zhuǎn)運(yùn)、細(xì)胞定位、穩(wěn)定性、翻譯和降解等RNA代謝過程中發(fā)揮著重要的調(diào)控功能，但其在轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控功能和機(jī)制尚未有系統(tǒng)的研究。通過ChIP-seq（染色質(zhì)免疫沉淀測(cè)序）技術(shù)大規(guī)模檢測(cè)了63個(gè)有細(xì)胞核定位的RNA結(jié)合蛋白與染色質(zhì)的相互作用，肖銳研究員等意外地發(fā)現(xiàn)約60%的RNA結(jié)合蛋白與染色質(zhì)有廣泛的相互作用，并且富集在基因啟動(dòng)子和增強(qiáng)子區(qū)域。
       更令人驚訝的是，該研究雖然只檢測(cè)了人類基因組中一小部分的RNA結(jié)合蛋白（<5%），卻發(fā)現(xiàn)約40%的活性染色質(zhì)區(qū)域和約70%的活性啟動(dòng)子區(qū)域都存在RNA結(jié)合蛋白的特異性結(jié)合，這提示RNA結(jié)合蛋白在染色質(zhì)水平存在著廣泛的功能和作用。隨后，通過GRO-seq（Global Nuclear Run-On測(cè)序）實(shí)驗(yàn)證實(shí)，部分RNA結(jié)合蛋白具有強(qiáng)烈的轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用。
       該研究還重點(diǎn)闡釋了RNA結(jié)合蛋白R(shí)BM25通過調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子YY1與染色質(zhì)的結(jié)合，進(jìn)而調(diào)控染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和轉(zhuǎn)錄激活與抑制的分子機(jī)制，全面展示了特異性的RNA結(jié)合蛋白介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄因子YY1的功能調(diào)控作用。整個(gè)發(fā)現(xiàn)提出了RNA結(jié)合蛋白作為轉(zhuǎn)錄因子或輔助因子調(diào)控轉(zhuǎn)錄的新概念，也開辟了RNA結(jié)合蛋白功能研究的新領(lǐng)域。
       肖銳一直專注于RNA生物學(xué)和功能基因組學(xué)領(lǐng)域開展研究工作，取得了一系列重要成果。近年來，他作為第一作者和通訊作者在Cell（1篇），Nature（2篇）和Molecular Cell（2篇）等頂尖期刊上發(fā)表了多篇高水平論文。
       美國加州大學(xué)圣地亞哥分校陳加余博士和梁征宇博士為該論文共同第一作者，付向東教授為共同通訊作者，共同作者包括武漢大學(xué)周宇教授和羅大極副教授，清華大學(xué)魯志教授、張奇?zhèn)ソ淌诤完愱栔硌芯繂T，廈門大學(xué)劉文教授，美國MIT Christopher Burge教授，UCSD Gene Yeo教授，康涅狄格大學(xué)Brenton Graveley教授和加拿大蒙特利爾大學(xué)Eric Lecuyer教授。該工作得到國家自然科學(xué)基金以及武漢大學(xué)“雙一流”人才科研啟動(dòng)經(jīng)費(fèi)的資助。