2007年12月21日，民政部基金會評估專家組一行6人來到清華大學教育基金會進行評估檢查。
　　基金會理事長賀美英，副理事長陳吉寧、楊家慶及全體工作人員熱情接待了民政部基金會評估專家組。
　　基金會領導向評估專家組做了工作匯報，并介紹了基金會概況。專家組對基金會的具體工作情況進行了逐一審查，詳細審閱了基金會的評估材料及宣傳資料，對基金會網(wǎng)站進行了瀏覽。專家組對基金會的工作給予了充分肯定。
　　學校和基金會領導高度重視此次評估工作。基金會為此確立了完善機制、著眼發(fā)展、以評促建、爭創(chuàng)一流的方針，對工作進行了系統(tǒng)全面的梳理和總結(jié)，并根據(jù)評估工作的具體要求，逐一進行了對照檢查和整改。在各級領導的親切關懷下，全體同志認真籌備，為完成評估工作做了大量深入細致的準備工作。通過這次評估工作促進了基金會的綜合能力建設，完善了監(jiān)管體制，為基金會創(chuàng)建“公開、透明、高效率和高公信力的一流基金會”打好了基礎，推進各項工作邁上了新臺階。
　　數(shù)據(jù)顯示，在一些重要的評價指標上 （如資金存量、運作收益、資金使用效率等），我?；饡谌珖幕饡忻星懊?。截至2007年底，基金會累計收入捐贈資金126534萬元；累計項目支出資金84628萬元；基金會自1999年進行資金運作以來，收益逐年增加，2006年以來實現(xiàn)收益達1.27億元，已成為學校資金的重要補充來源之一。
　　由于我?；饡欠枪蓟饡?，業(yè)務范圍受到國家”基金會管理條例”的限制,所以與國內(nèi)幾個主要的公募基金會相比,我們在資助項目的范圍、自主品牌的創(chuàng)立等方面還有不足。
　　這次評估是我國自開始民間組織管理以來，首次由政府主導對基金會情況進行的系統(tǒng)、全面和定性量化的檢查和摸底。根據(jù)此次評估的結(jié)果，國家將對公益性機構(gòu)進行評級，不同等級的公益性機構(gòu)將享受不同的政策支持與優(yōu)惠。整個基金會評估工作歷時4個月，參與專家51人，實地考察近400人次，對62家報送材料的基金會進行了評估。先后經(jīng)過基金會自評、專家組實地考察、評估委員會終審、媒體公示四個階段工作，最終形成了基金會評估等級。中國青少年發(fā)展基金會等6家基金會獲得5A級等級，中國教育發(fā)展基金會等13家基金會獲得4A級等級，中國癌癥基金會等19家基金會獲得3A級等級。清華大學教育基金會獲得4A級等級。