自2000年以來，我校重點學科建設(shè)取得了長足的發(fā)展。從2000年2個湖南省重點學科，3個國家中醫(yī)藥管理局重點學科發(fā)展到現(xiàn)在擁有國家教育部重點學科1個，國家中醫(yī)藥管理局重點學科3個，湖南省重點學科8個，共計12個重點學科。重點學科的發(fā)展，為我?？蒲小⒔虒W水平的整體提高作出了巨大的貢獻，學校目前承擔重大科研課題人員及科研獎勵，高級別的精品課程等幾乎來自各級重點學科。
　　為了促進重點學科的發(fā)展，學校在人、財、物各方面給予支持，7年來，學校共投入1037.845萬元用于科研、教學儀器設(shè)備的購置，其中90%用于重點學科。學校至2007年，已建立了包括各級科研實驗室、工程研究中心等科技平臺19個，為我校的科學研究提供了強有力的保障與工作條件。
　　為了爭取更多的學科進入高級別重點學科，“十五”期間確定了中藥學為校級重點學科，經(jīng)過5年建設(shè)，目前該學科已成為湖南省“十一”重點學科。“十一五”期間，學校確定了中醫(yī)基礎(chǔ)理論、中醫(yī)臨床基礎(chǔ)、微生物學、中醫(yī)婦科學、中醫(yī)兒科學、中藥化學與分析、中西醫(yī)結(jié)合基礎(chǔ)、社會醫(yī)學與衛(wèi)生事業(yè)管理、馬克思主義中國化研究等9個學科為校級重點學科，給予每年5-10萬元的建設(shè)經(jīng)費資助。