毛白楊基因組序列框架圖繪制完成
●本報(bào)訊 我國(guó)林木基因組學(xué)研究取得突破。北京林業(yè)大學(xué)的科學(xué)家選用百年古樹作為測(cè)序的樣本,利用最新的全基因組鳥槍法測(cè)序和拼接策略,繪制完成了毛白楊的基因組序列圖譜,標(biāo)志著毛白楊分子育種進(jìn)入基因組時(shí)代。
在“985”平臺(tái)建設(shè)資金支持下,北林大林木育種國(guó)家工程實(shí)驗(yàn)室的專家們用短短的6個(gè)月完成了這一開創(chuàng)性的研究。
專家解釋說(shuō),基因組學(xué)研究成果在育種中應(yīng)用后,將拓展野生種質(zhì)資源中優(yōu)異等位基因挖掘的廣度和深度,顯著提高復(fù)雜性狀改良的可操作性和新品種選育的效率,對(duì)于保障我國(guó)森林資源可持續(xù)發(fā)展有十分重要的意義。
據(jù)悉,基因組學(xué)是現(xiàn)代植物研究的熱點(diǎn)。目前,水稻、高粱、玉米、大豆、黃瓜已完成全基因組測(cè)序,棉花、苜蓿、番茄和煙草等全基因組測(cè)序也全面展開。北林大完成繪制完成的毛白楊基因組序列圖譜開創(chuàng)了我國(guó)林業(yè)基因組學(xué)研究的先河。
科學(xué)家告訴記者,之所以選擇毛白楊作為我國(guó)林木基因組學(xué)研究的突破口,是因它為我國(guó)重要的鄉(xiāng)土樹種和造林綠化中廣泛采用的速生用材樹種;我國(guó)擁有豐富的毛白楊遺傳資源,其遺傳育種的研究基礎(chǔ)較強(qiáng)。
據(jù)悉,科學(xué)家完成的毛白楊基因組大小約為6億個(gè)堿基對(duì),重疊群的平均長(zhǎng)度為39.7Kb,達(dá)到了框架圖標(biāo)準(zhǔn) (基因組常染色質(zhì)區(qū)覆蓋度達(dá)到90%以上,基因區(qū)覆蓋度達(dá)到95%以上,單堿基的錯(cuò)誤率達(dá)到1萬(wàn)分之一以內(nèi))。科學(xué)家將在此基礎(chǔ)上進(jìn)一步完善基因組序列圖譜,構(gòu)建物理圖譜和高密度連鎖圖譜,實(shí)現(xiàn)基因組序列圖譜與物理圖譜、連鎖圖譜的整合,繪制出毛白楊基因組精細(xì)圖譜,以保證基因組序列組裝和基因注釋的準(zhǔn)確性。
國(guó)際同行專家高度評(píng)價(jià)這樣一項(xiàng)重大研究。他們認(rèn)為,毛白楊基因組的注釋和分析大大便利了科學(xué)家發(fā)現(xiàn)經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)基因,使經(jīng)濟(jì)性狀的遺傳圖譜定位,跨越到基因組圖譜和功能基因的精確定位,標(biāo)志著毛白楊分子育種等相關(guān)研究正式進(jìn)入基因組時(shí)代,將推動(dòng)毛白楊育種技術(shù)的全面進(jìn)步。毛白楊基因組序列測(cè)序完成,對(duì)木本植物發(fā)育的分子機(jī)制的了解、木本植物在進(jìn)化歷程中地位的研究、可再生能源利用的研究具有重要的意義。(鐵錚)