2003年，學校在第七次黨代會上提出新時期奮斗目標：到2018年（建校120周年），建成整體水平國內(nèi)一流，優(yōu)勢學科達到國際先進水平，特色鮮明的研究型大學；到2048年（建校150周年），建成整體水平國內(nèi)一流，國際上有重要影響的開放性、綜合性、研究型大學。
　　十年來，學校一直致力于學校的全面性發(fā)展，形成了以生命科學為特色，多個學科協(xié)調發(fā)展的綜合性大學，學校的內(nèi)涵發(fā)生了很大的變化。
　　2008年，我校張啟發(fā)院士帶領的水稻國家創(chuàng)新研究團隊發(fā)現(xiàn)了一個可以同時控制水稻植株高矮、抽穗期和每穗粒數(shù)的Ghd7基因，為全球范圍內(nèi)農(nóng)作物產(chǎn)量提高邁出了關鍵一步。該成果同神舟七號等新聞一同入選2008年度“中國基礎研究十大新聞”。張啟發(fā)門下3位女博士生———研究控制秈粳稻雜種育性廣親和基因課題組的歐陽亦聃、丁寄花、陳炯炯，也因此走進人們的視野。同年年末，三人被評為“2008年校園媒體關注年度人物”。
　　2011年，該團隊再次成功克隆出正調控水稻粒重的GS5基因，這項研究成果已發(fā)表在國際頂 級 遺 傳 學 雜 志《Nature5Genetics》。GS5在水稻人工馴化和育種過程中起到了重要作用，并與種子大小的多樣性有關，影響因子高達36.377。研究成果入選教育部科學技術委員會組織評選的2011年度“中國高等學校十大科技進展”。
　　記者從相關部門了解到：2002年，我校作物學整體水平評估列全國同類學科第一。2004年，我校多門課程評為2003年度“國家精品課程”。2005年，學校整體進入“211”。2006年，我校接受教育部本科教學工作水平評估，評為優(yōu)秀。2009年，全國高?？冃гu價我校列第11名。2011年，我校國際學院、研究生院成立；GS5基因克隆與功能研究成果入選年度“中國高等學校十大科技進展”；學校再次榮膺全國文明單位。2007年到2009年，我校在全國一級學科評審排名中，作物學、園藝學、農(nóng)業(yè)資源利用、畜牧學、獸醫(yī)學、水產(chǎn)、農(nóng)林經(jīng)濟管理等一級學科均進入全國前五名。
　　除了關注師生專業(yè)方面的發(fā)展，十年來，學校還一直努力加強學校的人文學科建設，提高學校師生的人文素養(yǎng)，將學生培養(yǎng)為文理兼?zhèn)涞娜瞬?，為學生提供更大的發(fā)展空間。
　　2012年3月15日，學校召開人文社會科學學科建設工作會議。同日，馬克思主義學院正式揭牌成立，我校文科建設也從此進入新的發(fā)展時期。回顧我校文科建設走過的歷程，2008年我校成立思想政治理論課部，強化了對思想領域學科的重視。學校為了強化學科建設，在2009年將馬克思主義中國化研究定為校級重點學科—————通過二級學科點的建設，運用較好的學科隊伍和成果支撐帶動一級學科點“馬克思主義理論”的建設，并為申報一級學科的碩士點做準備。
　　近年來，學校一直注重發(fā)展人文社會學科，并在“十二五”規(guī)劃中做了戰(zhàn)略的定位和規(guī)劃，明確了發(fā)展的目標，提出了發(fā)展的舉措，2012年工作要點提出要啟動人文社會學科的規(guī)劃工作。2012年，馬克思主義學院正式成立，意外著經(jīng)過幾十年的推敲摸索，我校文科建設平臺從無到有，人文社科體系從單一到多元，為我校整體文科水平的進一步提高構筑了堅實基礎。
　　副校長張獻龍曾指出，目前我校人文社會科學學科發(fā)展相對滯后，與綜合性大學相比尚有較大距離。隨著學校事業(yè)的發(fā)展，歷史要求我校學科布局更加合理，我們力爭在10年內(nèi)達到農(nóng)、工、文相關學科4:2:4的比例。
　　2011年6月3日，我校國際學院成立暨揭牌儀式在行政樓會議室舉行。在成立儀式上，校長鄧秀新指出，對外開放辦學既是落實國家教育綱要的要求，又是推動我校又好又快發(fā)展的必由之路。國際交流學院將是我校對外交流與合作的又一個重要窗口和橋梁。
　　這是我校在對外交流發(fā)展史上的再一次突破。自2002年，學校與美國、加拿大、英國、法國等40多個國家和地區(qū)的150余所院校、科研機構開展合作交流。十年來，我校共派出2209人次出國（境）交流，獲批3個引智基地，國（境）外來訪總人數(shù)7000人次，有52個國家209名留學生在讀。先后舉辦37次高水平國際會議、雙邊會議，成功主辦第12屆國際油菜大會、第11屆國際柑橘學大會。
　　2002年以來，學校新增一級學科碩士學位、博士學位授予權專業(yè)13個和7個，總數(shù)分別為19個和13個；新增二級學科碩士學位、博士學位授予權專業(yè)55個和35個，總數(shù)分別為98個和61個；新增本科專業(yè)10個；新增一級國家重點學科、二級國家重點學科、二級國家重點培育學科各1個、4個、1個，總數(shù)分別為1個、6個和1個；新增一級省部級重點學科、二級省部級重點學科7個、25個，總數(shù)分別為7個、36個；新增博士后科研流動站4個，總數(shù)為10個。新增碩士專業(yè)學位授權點6個。2002年以來，新增中國工程院院士2人、“長江學者獎勵計劃”特聘（講座）教授7人、“國家杰出青年科學基金”獲得者6人、國家教學名師4人，現(xiàn)有國家“百千萬人才工程”13人。國家級教學團隊7個、省部級教學團隊8個。新增國家自然科學基金創(chuàng)新群體3個、新增省部級科技創(chuàng)新團隊17個，3人入選國家“千人計劃”、入選現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術體系首席科學家1人、美國科學院外籍院士1人。
　　今天，學校已站在從“局部創(chuàng)優(yōu)勢”到“整體上水平”的新的歷史起點，面向未來，朝著建設特色鮮明的研究型大學的宏偉目標前進。