南京醫(yī)科大學病理生理學系前身為南京醫(yī)學院病理生理教研室，為1955年國內(nèi)首批建立的病理生理學科之一,1981年成為國務院學位辦首批碩士學位授予點，1988年被原江蘇省教委遴選為重點學科，1994年晉級為江蘇省重點學科。2000年成為博士學位授權點。2001年成為基礎醫(yī)學博士后科研流動站的主要學科，2002年被批準為江蘇省人類功能基因組學重點實驗室，2007年被遴選為國家重點 （培育）學科，2011年獲得批準成立江蘇省心血管病分子干預重點實驗室。
　　1990年為適應科研不斷發(fā)展的需要，在學科內(nèi)組建動脈粥樣硬化研究中心，該中心于1974年開始涉足動脈粥樣硬化的研究,首先建立動物模型,研究多種因素對動脈粥樣硬化發(fā)生、發(fā)展及消退的影響。隨后，在眾多影響因素中選擇了 “脂蛋白與動脈粥樣硬化的關系”作為進一步研究的方向。當時Miller等提出的“HDL(高密度脂蛋白)可能是對抗動脈粥樣硬化的因素”這一學說開始風行，國內(nèi)尚屬空白。該中心抓住這一動向，首先建立血清HDL測定方法，調(diào)查了數(shù)千例不同人群血清HDL水平及各種影響因素。調(diào)查發(fā)現(xiàn)我國人群HDL水平較歐美白人為高、冠心病發(fā)生率則較之為低，兩者可能有一定關聯(lián)，還證實高血脂、吸煙、肥胖、體力活動減少以及性別和年齡等因素都在不同程度上影響HDL水平。研究結(jié)果發(fā)表于“Atherosclerosis”、“中華醫(yī)學雜志”等知名雜志，并參加在澳大利亞召開的第7屆國際動脈粥樣硬化學術會議交流，受到國內(nèi)外學者的重視。1979年此成果獲江蘇省人民政府科技進步三等獎。
　　此后,該中心繼續(xù)瞄準國際研究前沿,在國內(nèi)率先建立放射配體法LDL(低密度脂蛋白)受體功能測定技術，于1982年在我國首次從LDL受體水平確診五個家族性高膽固醇血癥(FH)家族，后又在山東、安徽、內(nèi)蒙古、上海等地陸續(xù)發(fā)現(xiàn)FH患者。另外還建立了HDL受體和清道夫受體等檢測方法，開展有關研究工作。1986年起相繼承擔國家“七五”、“八五”科技攻關項目，進一步就我國家族性高膽固醇血癥的特點、發(fā)病機理、診斷和治療方面，從整體、器官和細胞分子各個水平開展全方位深入研究，取得一系列成果。主要包括：在國內(nèi)最早制備成功 apoB-100單克隆抗體；在國際上首次采用人胎肝分離純化LDL受體并成功制備高特異性單克隆抗體；完成對中國人群LDL受體基因限制性片段長度多態(tài)性與血脂水平關系的分析研究、LDL受體基因表達調(diào)控和LDL受體基因cDNA在受體缺陷CHO細胞的表達研究；對我國10名FH純合子患者LDL受體基因突變位點的分析結(jié)果表明我國FH患者LDL受體基因的突變類型與國外其他民族有異；在血脂異常和FH基因診斷基因治療的基礎研究方面也取得一定成果。上述研究結(jié)果除國內(nèi)雜志外,也發(fā)表于國外 Arte鄄riosclerosis、Atherosclerosis、BBA、Biochemistry和Hepatology等知名雜志，先后參加1988、1994和1997年分別在巴黎、羅馬和京都召開的第8、10、11屆國際動脈粥樣硬化學術會議和其他國際性學術會議交流,并獲得了我國衛(wèi)生部科技進步二等獎一項(1985年)、三等獎一項(1992年),國家教委科技進步二等獎一項(1996年),江蘇省政府科技進步二等獎兩項(1992、1997年)和三等獎四項(1986、1989、1992和2001年)。
　　由于該中心始終堅持動脈粥樣硬化發(fā)病機制的研究，三十多年持之以恒，形成了自己的特色和優(yōu)勢。隨后在新學科帶頭人陳琪教授帶領下，進一步拓寬研究思路和領域，以動脈粥樣硬化相關基因、受體及其信號調(diào)控機制等方面的研究為重點，在清道夫受體的信號基序研究等方面取得新突破：發(fā)現(xiàn)并證實了A類清道夫受體（SR-A）介導內(nèi)移新的信號序列，獲得SR-A參與信號轉(zhuǎn)導的直接證據(jù)，并發(fā)現(xiàn)SR-A胞漿域結(jié)合蛋白，研究成果發(fā)表于ArteriosclerThrombVascBiol，JBiolChem等國際期刊。近年來在核模式受體/轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子翻譯后修飾及其在心血管疾病中作用機制的研究也取得了階段性成果，發(fā)表于CircRes,NucleicAcidsRes,和MolCellBiol等國際權威刊物。此外，還以獲得的B類國家杰出青年基金項目資助為依托，與美國哈佛大學合作開展細胞損傷的分子機制研究。近五年來，共承擔國家“973”課題3項，“863”項目課題1項，國家自然科學基金13項，其中國家自然科學基金重點項目1項、面上項目9項、青年基金2項、國家自然科學基金海外青年學者合作研究基金1項，部省級課題多項。以第一完成單位在國際學術刊物發(fā)表SCI論文50余篇，主編或參編專著3部，主辦國際國內(nèi)學術會議各2次，獲得國家發(fā)明專利2項。
　　該中心原主任、學術帶頭人蔡海江教授為中國病理生理學會動脈粥樣硬化專業(yè)委員會主要創(chuàng)始人之一，一直擔任該委員會主任委員兼任國際動脈粥樣硬化學會理事和“中國動脈硬化雜志”名譽主編。范樂明教授和陳琪教授均曾先后擔任動脈粥樣硬化專業(yè)委員會副主任委員和“中國動脈硬化雜志”常務編委。2000年10月和2010年10月先后兩次承辦在南京召開的中國病理生理學會第七屆和第九屆全國代表大會暨學術會議。2013年陳琪教授創(chuàng)建“心血管病發(fā)病機制及新靶點發(fā)現(xiàn)協(xié)同創(chuàng)新團隊”，并聯(lián)合戴一凡教授領導的“心血管病模式動物創(chuàng)新團隊”、朱東亞教授領導的“心腦血管病創(chuàng)新藥物研究創(chuàng)新團隊”以及孔祥清教授和陳紹良教授領導的“心血管病介入和生物學治療創(chuàng)新團隊”共同組建“江蘇省心血管病轉(zhuǎn)化醫(yī)學協(xié)同創(chuàng)新中心”，為將動脈粥樣硬化和心血管疾病的基礎研究成果向臨床應用轉(zhuǎn)化搭建了直通金橋。可以預見，在全體同仁的努力下，必將收獲更加豐碩的成果。